Udržování čistoty bazénu je zásadní pro prevenci šíření nemocí, předcházení nehodám a předcházení infekcím. Komplexní čištění bazénu se doporučuje provádět alespoň jednou týdně, zejména v sezónách častého používání. Pravidelné čištění zahrnuje nejen mytí filtračních kuliček, ale také kontrolu kvality vody, čištění stěn a podlahy bazénu a dalších zařízení, jako jsou čerpadla a filtrační systémy.